Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms