Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTENP60484 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTENP60484 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTENP60484 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTENP60484 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTENP60484 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTENP60484 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTENP60484 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTENP60484 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTENP60484 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTENP60484 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTENP60484 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTENP60484 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTENP60484 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTENP60484 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTENP60484 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTENP60484 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTENP60484 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTENP60484 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTENP60484 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTENP60484 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTENP60484 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTENP60484 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTENP60484 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTENP60484 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTENP60484 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTENP60484 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTENP60484 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTENP60484 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTENP60484 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTENP60484 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTENP60484 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTENP60484 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTENP60484 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTENP60484 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTENP60484 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTENP60484 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTENP60484 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTENP60484 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTENP60484 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTENP60484 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTENP60484 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTENP60484 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTENP60484 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTENP60484 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTENP60484 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTENP60484 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTENP60484 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTENP60484 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTENP60484 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTENP60484 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTENP60484 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTENP60484 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTENP60484 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTENP60484 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTENP60484 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTENP60484 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTENP60484 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTENP60484 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTENP60484 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTENP60484 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTENP60484 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTENP60484 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTENP60484 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms