Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00313P59037 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms