Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA9P57773 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA9P57773 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJA9P57773 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA9P57773 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA9P57773 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA9P57773 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA9P57773 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA9P57773 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA9P57773 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA9P57773 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJA9P57773 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA9P57773 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA9P57773 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA9P57773 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA9P57773 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA9P57773 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA9P57773 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GJA9P57773 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA9P57773 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA9P57773 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA9P57773 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA9P57773 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA9P57773 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA9P57773 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA9P57773 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA9P57773 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA9P57773 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA9P57773 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA9P57773 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA9P57773 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA9P57773 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA9P57773 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA9P57773 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA9P57773 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA9P57773 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA9P57773 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA9P57773 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA9P57773 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA9P57773 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA9P57773 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA9P57773 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA9P57773 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA9P57773 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA9P57773 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA9P57773 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA9P57773 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA9P57773 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA9P57773 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA9P57773 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA9P57773 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA9P57773 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA9P57773 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA9P57773 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA9P57773 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA9P57773 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA9P57773 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA9P57773 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA9P57773 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA9P57773 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA9P57773 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA9P57773 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA9P57773 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA9P57773 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA9P57773 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA9P57773 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA9P57773 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA9P57773 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA9P57773 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA9P57773 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA9P57773 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA9P57773 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA9P57773 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA9P57773 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA9P57773 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA9P57773 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA9P57773 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJA9P57773 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA9P57773 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA9P57773 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA9P57773 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA9P57773 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA9P57773 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA9P57773 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA9P57773 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms