Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN15P56746 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms