Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPHB4P54760 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB4P54760 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms