Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P54278 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P54278 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P54278 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P54278 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P54278 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P54278 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P54278 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P54278 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P54278 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P54278 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P54278 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P54278 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P54278 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P54278 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P54278 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P54278 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P54278 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P54278 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P54278 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P54278 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P54278 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P54278 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P54278 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P54278 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P54278 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P54278 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P54278 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P54278 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P54278 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P54278 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P54278 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P54278 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P54278 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P54278 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P54278 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P54278 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P54278 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P54278 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P54278 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P54278 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P54278 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P54278 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P54278 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P54278 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P54278 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P54278 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P54278 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P54278 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P54278 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P54278 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P54278 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P54278 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMS2P54278 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMS2P54278 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P54278 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P54278 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P54278 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P54278 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P54278 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P54278 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P54278 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P54278 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P54278 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P54278 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P54278 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P54278 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P54278 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P54278 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P54278 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P54278 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P54278 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMS2P54278 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMS2P54278 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P54278 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P54278 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P54278 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P54278 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P54278 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P54278 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P54278 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMS2P54278 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P54278 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P54278 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P54278 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P54278 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P54278 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P54278 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms