Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2KP53803 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 452.6 ms