Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RORCP51449 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORCP51449 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORCP51449 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORCP51449 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORCP51449 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORCP51449 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORCP51449 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORCP51449 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORCP51449 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORCP51449 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORCP51449 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RORCP51449 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RORCP51449 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RORCP51449 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RORCP51449 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RORCP51449 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RORCP51449 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RORCP51449 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RORCP51449 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RORCP51449 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RORCP51449 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RORCP51449 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RORCP51449 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RORCP51449 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RORCP51449 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RORCP51449 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RORCP51449 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RORCP51449 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RORCP51449 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RORCP51449 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RORCP51449 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RORCP51449 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RORCP51449 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RORCP51449 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RORCP51449 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RORCP51449 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RORCP51449 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RORCP51449 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RORCP51449 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RORCP51449 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RORCP51449 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RORCP51449 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RORCP51449 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RORCP51449 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RORCP51449 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RORCP51449 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RORCP51449 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RORCP51449 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RORCP51449 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RORCP51449 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RORCP51449 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RORCP51449 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms