Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX5P50542 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX5P50542 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX5P50542 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX5P50542 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX5P50542 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX5P50542 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX5P50542 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX5P50542 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX5P50542 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX5P50542 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX5P50542 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX5P50542 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX5P50542 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX5P50542 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX5P50542 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX5P50542 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX5P50542 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX5P50542 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX5P50542 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX5P50542 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX5P50542 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX5P50542 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX5P50542 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX5P50542 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX5P50542 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX5P50542 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX5P50542 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX5P50542 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX5P50542 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX5P50542 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX5P50542 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX5P50542 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX5P50542 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX5P50542 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX5P50542 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX5P50542 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX5P50542 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX5P50542 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX5P50542 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX5P50542 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX5P50542 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX5P50542 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX5P50542 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX5P50542 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX5P50542 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX5P50542 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX5P50542 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX5P50542 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX5P50542 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX5P50542 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX5P50542 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX5P50542 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX5P50542 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX5P50542 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX5P50542 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX5P50542 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX5P50542 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX5P50542 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX5P50542 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX5P50542 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX5P50542 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms