Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL1P47992 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL1P47992 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL1P47992 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL1P47992 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCL1P47992 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL1P47992 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL1P47992 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL1P47992 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XCL1P47992 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCL1P47992 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms