Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA1P43355 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA1P43355 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms