Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD52P43351 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD52P43351 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD52P43351 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD52P43351 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD52P43351 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD52P43351 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD52P43351 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD52P43351 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD52P43351 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD52P43351 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD52P43351 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD52P43351 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD52P43351 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD52P43351 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD52P43351 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD52P43351 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD52P43351 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD52P43351 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD52P43351 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAD52P43351 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD52P43351 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD52P43351 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD52P43351 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD52P43351 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAD52P43351 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD52P43351 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD52P43351 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD52P43351 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD52P43351 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD52P43351 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD52P43351 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD52P43351 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD52P43351 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD52P43351 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD52P43351 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD52P43351 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD52P43351 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD52P43351 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD52P43351 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD52P43351 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD52P43351 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD52P43351 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD52P43351 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD52P43351 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD52P43351 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD52P43351 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD52P43351 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD52P43351 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD52P43351 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD52P43351 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD52P43351 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD52P43351 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD52P43351 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD52P43351 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD52P43351 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD52P43351 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD52P43351 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD52P43351 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD52P43351 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD52P43351 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD52P43351 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD52P43351 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD52P43351 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAD52P43351 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAD52P43351 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD52P43351 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD52P43351 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD52P43351 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD52P43351 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD52P43351 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD52P43351 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD52P43351 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RAD52P43351 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms