Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSKP41240 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSKP41240 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSKP41240 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSKP41240 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSKP41240 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSKP41240 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSKP41240 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSKP41240 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSKP41240 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSKP41240 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSKP41240 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSKP41240 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSKP41240 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSKP41240 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSKP41240 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSKP41240 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSKP41240 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSKP41240 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSKP41240 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CSKP41240 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CSKP41240 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSKP41240 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSKP41240 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSKP41240 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSKP41240 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSKP41240 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSKP41240 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSKP41240 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSKP41240 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSKP41240 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSKP41240 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSKP41240 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSKP41240 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSKP41240 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSKP41240 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSKP41240 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSKP41240 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSKP41240 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSKP41240 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSKP41240 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSKP41240 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSKP41240 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSKP41240 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSKP41240 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSKP41240 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSKP41240 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CSKP41240 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSKP41240 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSKP41240 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSKP41240 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSKP41240 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSKP41240 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSKP41240 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSKP41240 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSKP41240 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSKP41240 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSKP41240 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSKP41240 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSKP41240 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSKP41240 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSKP41240 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSKP41240 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSKP41240 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSKP41240 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSKP41240 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSKP41240 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSKP41240 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSKP41240 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSKP41240 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSKP41240 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSKP41240 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSKP41240 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSKP41240 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms