Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC5P40937 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC5P40937 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC5P40937 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC5P40937 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC5P40937 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC5P40937 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC5P40937 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC5P40937 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC5P40937 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC5P40937 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC5P40937 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFC5P40937 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFC5P40937 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFC5P40937 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFC5P40937 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFC5P40937 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFC5P40937 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFC5P40937 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFC5P40937 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFC5P40937 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFC5P40937 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RFC5P40937 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFC5P40937 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFC5P40937 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFC5P40937 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFC5P40937 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFC5P40937 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFC5P40937 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFC5P40937 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFC5P40937 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFC5P40937 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFC5P40937 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFC5P40937 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFC5P40937 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFC5P40937 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFC5P40937 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFC5P40937 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFC5P40937 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFC5P40937 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RFC5P40937 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFC5P40937 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFC5P40937 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFC5P40937 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFC5P40937 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFC5P40937 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFC5P40937 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFC5P40937 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFC5P40937 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RFC5P40937 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFC5P40937 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFC5P40937 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFC5P40937 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFC5P40937 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFC5P40937 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFC5P40937 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFC5P40937 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFC5P40937 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFC5P40937 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFC5P40937 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFC5P40937 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFC5P40937 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFC5P40937 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFC5P40937 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFC5P40937 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFC5P40937 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFC5P40937 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFC5P40937 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFC5P40937 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFC5P40937 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFC5P40937 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFC5P40937 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFC5P40937 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFC5P40937 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFC5P40937 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFC5P40937 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFC5P40937 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFC5P40937 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFC5P40937 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFC5P40937 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFC5P40937 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFC5P40937 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFC5P40937 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFC5P40937 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFC5P40937 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFC5P40937 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFC5P40937 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms