Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FEN1P39748 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FEN1P39748 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FEN1P39748 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FEN1P39748 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FEN1P39748 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FEN1P39748 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FEN1P39748 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FEN1P39748 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FEN1P39748 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FEN1P39748 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FEN1P39748 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FEN1P39748 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FEN1P39748 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FEN1P39748 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FEN1P39748 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FEN1P39748 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FEN1P39748 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FEN1P39748 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FEN1P39748 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FEN1P39748 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FEN1P39748 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FEN1P39748 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FEN1P39748 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FEN1P39748 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FEN1P39748 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FEN1P39748 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FEN1P39748 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FEN1P39748 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FEN1P39748 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FEN1P39748 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FEN1P39748 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FEN1P39748 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FEN1P39748 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FEN1P39748 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FEN1P39748 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FEN1P39748 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FEN1P39748 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FEN1P39748 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FEN1P39748 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FEN1P39748 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FEN1P39748 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FEN1P39748 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FEN1P39748 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FEN1P39748 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FEN1P39748 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FEN1P39748 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FEN1P39748 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FEN1P39748 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FEN1P39748 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FEN1P39748 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FEN1P39748 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms