Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL3P39023 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL3P39023 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL3P39023 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL3P39023 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL3P39023 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL3P39023 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL3P39023 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL3P39023 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL3P39023 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL3P39023 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL3P39023 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL3P39023 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL3P39023 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL3P39023 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL3P39023 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL3P39023 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL3P39023 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL3P39023 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL3P39023 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL3P39023 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL3P39023 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL3P39023 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL3P39023 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL3P39023 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL3P39023 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL3P39023 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL3P39023 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL3P39023 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL3P39023 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL3P39023 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL3P39023 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL3P39023 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL3P39023 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL3P39023 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL3P39023 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL3P39023 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL3P39023 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL3P39023 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL3P39023 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL3P39023 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL3P39023 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL3P39023 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL3P39023 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL3P39023 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL3P39023 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL3P39023 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL3P39023 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL3P39023 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL3P39023 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL3P39023 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL3P39023 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL3P39023 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL3P39023 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL3P39023 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL3P39023 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms