Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPA9P38646 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms