Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 DBNDD1-204ENST00000568330 567 ntTSL 514.72□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 39
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GTF2F1P35269 NOL4L-204ENST00000375677 541 ntTSL 312.86□□□□□ -0.351e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-238ENST00000493299 559 ntTSL 412.86□□□□□ -0.351e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-228ENST00000456033 694 ntTSL 512.72□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 ABT1-201ENST00000274849 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-221ENST00000441154 4311 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 PHF19-205ENST00000439674 556 ntTSL 411.86□□□□□ -0.511e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-223ENST00000444134 558 ntTSL 511.64□□□□□ -0.551e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-217ENST00000428387 524 ntTSL 411.54□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 39
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GTF2F1P35269 EIF4G1-236ENST00000484862 590 ntTSL 210.85□□□□□ -0.671e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 FIS1-205ENST00000463406 527 ntTSL 310.43□□□□□ -0.741e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-229ENST00000457456 983 ntTSL 29.51□□□□□ -0.891e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 MAST2-205ENST00000470809 640 ntTSL 35.54□□□□□ -1.521e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.397e-11■■■■■ 38.9
GTF2F1P35269 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.336e-9■■■■■ 38.8
GTF2F1P35269 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.465e-7■■■■■ 38.8
GTF2F1P35269 ZNF444-206ENST00000587664 568 ntTSL 322.16■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 38.8
GTF2F1P35269 GREB1-207ENST00000432985 2052 ntTSL 1 (best)14.83□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 38.7
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GTF2F1P35269 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 38.7
GTF2F1P35269 CSNK1D-223ENST00000584472 586 ntTSL 417.24■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 38.7
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GTF2F1P35269 CSNK1D-226ENST00000585026 563 ntTSL 512.23□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 38.7
GTF2F1P35269 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 38.7
GTF2F1P35269 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.471e-9■■■■■ 38.7
GTF2F1P35269 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.431e-9■■■■■ 38.7
GTF2F1P35269 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.191e-9■■■■■ 38.7
GTF2F1P35269 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 228.68■■■□□ 2.181e-9■■■■■ 38.7
GTF2F1P35269 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.071e-9■■■■■ 38.7
GTF2F1P35269 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.591e-12■■■■■ 38.6
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GTF2F1P35269 C11orf24-205ENST00000530166 941 ntTSL 319.29■□□□□ 0.682e-9■■■■■ 38.6
GTF2F1P35269 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.642e-9■■■■■ 38.6
GTF2F1P35269 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.95■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 38.6
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GTF2F1P35269 TSPAN4-220ENST00000532375 518 ntTSL 515.23■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 38.6
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GTF2F1P35269 TDP2-205ENST00000480495 714 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 38.5
GTF2F1P35269 TDP2-204ENST00000478507 573 ntTSL 514.69□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 38.5
GTF2F1P35269 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 34.78□□□□□ -1.647e-7■■■■■ 38.5
GTF2F1P35269 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 422.6■■□□□ 1.213e-7■■■■■ 38.5
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GTF2F1P35269 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.276e-10■■■■■ 38.5
GTF2F1P35269 RCOR3-205ENST00000472734 452 ntTSL 222.46■■□□□ 1.196e-10■■■■■ 38.5
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GTF2F1P35269 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.546e-10■■■■■ 38.5
GTF2F1P35269 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 USP32-202ENST00000393003 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.447e-16■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 DNAJC6-207ENST00000494710 1621 ntTSL 526.97■■□□□ 1.915e-13■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.665e-13■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.945e-13■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.125e-13■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 DNAJC6-206ENST00000483402 409 ntTSL 36.81□□□□□ -1.325e-13■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 DNAJC6-204ENST00000463018 546 ntTSL 36.33□□□□□ -1.45e-13■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 225.3■■□□□ 1.644e-9■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.61e-10■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 BDH1-205ENST00000432819 955 ntTSL 522.55■■□□□ 1.21e-10■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 BDH1-209ENST00000446746 868 ntTSL 322.55■■□□□ 1.21e-10■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.464e-9■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-10■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.061e-10■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.051e-10■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 BDH1-214ENST00000479425 1144 ntTSL 214.98□□□□□ -0.011e-10■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 BDH1-206ENST00000434143 659 ntTSL 313.62□□□□□ -0.231e-10■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 BDH1-213ENST00000477015 595 ntTSL 211.8□□□□□ -0.521e-10■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 PHF14-205ENST00000473050 695 ntTSL 210.75□□□□□ -0.694e-9■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 PHF14-204ENST00000470665 1005 ntTSL 26.58□□□□□ -1.364e-9■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 PHF14-211ENST00000493922 408 ntTSL 34.44□□□□□ -1.74e-9■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 PHF14-203ENST00000469407 1991 ntTSL 22.82□□□□□ -1.964e-9■■■■■ 38.4
GTF2F1P35269 PTPN12-209ENST00000460731 582 ntTSL 25.93□□□□□ -1.466e-20■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 38.3
GTF2F1P35269 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 38.3
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