Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP2P32456 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP2P32456 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP2P32456 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP2P32456 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP2P32456 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP2P32456 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP2P32456 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP2P32456 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP2P32456 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP2P32456 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP2P32456 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP2P32456 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP2P32456 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP2P32456 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP2P32456 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP2P32456 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP2P32456 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP2P32456 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP2P32456 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP2P32456 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP2P32456 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP2P32456 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP2P32456 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP2P32456 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP2P32456 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP2P32456 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP2P32456 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP2P32456 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP2P32456 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP2P32456 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP2P32456 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP2P32456 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP2P32456 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP2P32456 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP2P32456 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP2P32456 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP2P32456 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP2P32456 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP2P32456 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP2P32456 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP2P32456 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP2P32456 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP2P32456 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP2P32456 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP2P32456 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP2P32456 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP2P32456 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP2P32456 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP2P32456 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP2P32456 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP2P32456 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP2P32456 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP2P32456 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP2P32456 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP2P32456 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP2P32456 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP2P32456 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP2P32456 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP2P32456 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP2P32456 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP2P32456 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP2P32456 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP2P32456 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP2P32456 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP2P32456 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP2P32456 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP2P32456 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP2P32456 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP2P32456 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP2P32456 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP2P32456 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP2P32456 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBP2P32456 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBP2P32456 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP2P32456 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP2P32456 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms