Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC8A1P32418 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC8A1P32418 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms