Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC27P30260 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CDC27P30260 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CDC27P30260 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC27P30260 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC27P30260 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC27P30260 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC27P30260 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC27P30260 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC27P30260 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC27P30260 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC27P30260 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC27P30260 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC27P30260 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC27P30260 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC27P30260 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC27P30260 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC27P30260 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC27P30260 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC27P30260 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC27P30260 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC27P30260 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC27P30260 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC27P30260 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC27P30260 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC27P30260 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC27P30260 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC27P30260 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC27P30260 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC27P30260 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC27P30260 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC27P30260 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC27P30260 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC27P30260 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC27P30260 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC27P30260 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC27P30260 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC27P30260 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC27P30260 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC27P30260 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC27P30260 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC27P30260 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC27P30260 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC27P30260 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC27P30260 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC27P30260 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC27P30260 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC27P30260 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC27P30260 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC27P30260 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC27P30260 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC27P30260 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC27P30260 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC27P30260 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC27P30260 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC27P30260 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC27P30260 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC27P30260 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC27P30260 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC27P30260 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC27P30260 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC27P30260 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC27P30260 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC27P30260 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC27P30260 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC27P30260 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC27P30260 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC27P30260 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC27P30260 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC27P30260 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC27P30260 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC27P30260 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC27P30260 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC27P30260 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC27P30260 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC27P30260 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC27P30260 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms