Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP1P29466 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP1P29466 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP1P29466 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP1P29466 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP1P29466 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP1P29466 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP1P29466 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP1P29466 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP1P29466 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP1P29466 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP1P29466 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP1P29466 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CASP1P29466 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP1P29466 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP1P29466 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP1P29466 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP1P29466 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP1P29466 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP1P29466 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP1P29466 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP1P29466 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP1P29466 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP1P29466 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP1P29466 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP1P29466 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP1P29466 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP1P29466 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP1P29466 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP1P29466 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP1P29466 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASP1P29466 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP1P29466 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP1P29466 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP1P29466 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP1P29466 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP1P29466 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP1P29466 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP1P29466 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP1P29466 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP1P29466 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP1P29466 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP1P29466 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP1P29466 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP1P29466 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP1P29466 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP1P29466 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP1P29466 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP1P29466 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP1P29466 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP1P29466 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms