Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF8P28908 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF8P28908 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms