Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE4AP27815 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PDE4AP27815 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms