Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRDP23468 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRDP23468 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRDP23468 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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