Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ME2P23368 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME2P23368 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME2P23368 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME2P23368 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME2P23368 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ME2P23368 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME2P23368 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME2P23368 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME2P23368 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME2P23368 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME2P23368 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ME2P23368 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME2P23368 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME2P23368 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME2P23368 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME2P23368 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME2P23368 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME2P23368 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME2P23368 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME2P23368 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME2P23368 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME2P23368 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME2P23368 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME2P23368 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME2P23368 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME2P23368 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME2P23368 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME2P23368 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME2P23368 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ME2P23368 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME2P23368 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME2P23368 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME2P23368 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ME2P23368 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME2P23368 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ME2P23368 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ME2P23368 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ME2P23368 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ME2P23368 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms