Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPAP23025 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPAP23025 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPAP23025 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPAP23025 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPAP23025 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPAP23025 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPAP23025 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPAP23025 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPAP23025 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPAP23025 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPAP23025 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPAP23025 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPAP23025 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPAP23025 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPAP23025 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPAP23025 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPAP23025 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPAP23025 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPAP23025 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPAP23025 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPAP23025 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPAP23025 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPAP23025 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPAP23025 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
XPAP23025 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPAP23025 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPAP23025 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPAP23025 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPAP23025 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPAP23025 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPAP23025 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPAP23025 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPAP23025 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XPAP23025 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XPAP23025 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XPAP23025 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XPAP23025 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XPAP23025 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPAP23025 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XPAP23025 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPAP23025 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPAP23025 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPAP23025 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPAP23025 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPAP23025 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPAP23025 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPAP23025 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPAP23025 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPAP23025 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPAP23025 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPAP23025 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XPAP23025 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XPAP23025 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPAP23025 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XPAP23025 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPAP23025 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPAP23025 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPAP23025 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPAP23025 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPAP23025 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPAP23025 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPAP23025 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPAP23025 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPAP23025 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPAP23025 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPAP23025 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPAP23025 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPAP23025 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms