Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4BPBP20851 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C4BPBP20851 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms