Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFE3P19532 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFE3P19532 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFE3P19532 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFE3P19532 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFE3P19532 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFE3P19532 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFE3P19532 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFE3P19532 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFE3P19532 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFE3P19532 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFE3P19532 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFE3P19532 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFE3P19532 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFE3P19532 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFE3P19532 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TFE3P19532 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFE3P19532 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFE3P19532 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFE3P19532 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFE3P19532 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFE3P19532 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFE3P19532 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFE3P19532 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFE3P19532 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFE3P19532 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFE3P19532 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFE3P19532 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFE3P19532 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFE3P19532 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFE3P19532 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFE3P19532 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFE3P19532 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFE3P19532 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFE3P19532 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFE3P19532 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFE3P19532 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFE3P19532 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFE3P19532 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFE3P19532 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFE3P19532 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TFE3P19532 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFE3P19532 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFE3P19532 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFE3P19532 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms