Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2CP19387 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms