Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN2P17655 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms