Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMN1P16949 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMN1P16949 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMN1P16949 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMN1P16949 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMN1P16949 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STMN1P16949 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STMN1P16949 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STMN1P16949 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STMN1P16949 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STMN1P16949 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STMN1P16949 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STMN1P16949 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STMN1P16949 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STMN1P16949 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STMN1P16949 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STMN1P16949 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STMN1P16949 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STMN1P16949 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STMN1P16949 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STMN1P16949 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STMN1P16949 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STMN1P16949 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STMN1P16949 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STMN1P16949 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STMN1P16949 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms