Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFAPP14136 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFAPP14136 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFAPP14136 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFAPP14136 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFAPP14136 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFAPP14136 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFAPP14136 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFAPP14136 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFAPP14136 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GFAPP14136 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFAPP14136 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFAPP14136 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFAPP14136 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFAPP14136 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFAPP14136 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFAPP14136 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFAPP14136 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFAPP14136 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFAPP14136 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFAPP14136 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFAPP14136 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFAPP14136 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFAPP14136 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFAPP14136 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GFAPP14136 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GFAPP14136 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GFAPP14136 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFAPP14136 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFAPP14136 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFAPP14136 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFAPP14136 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFAPP14136 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFAPP14136 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFAPP14136 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFAPP14136 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFAPP14136 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFAPP14136 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFAPP14136 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFAPP14136 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFAPP14136 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFAPP14136 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFAPP14136 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFAPP14136 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFAPP14136 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFAPP14136 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GFAPP14136 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GFAPP14136 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GFAPP14136 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFAPP14136 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms