Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COX4I1P13073 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I1P13073 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms