Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB1P11230 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNB1P11230 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms