Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRFP10586 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRFP10586 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
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