Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L7P0C7H9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP17L7P0C7H9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms