Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
C4BP0C0L5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
C4BP0C0L5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C4BP0C0L5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
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