Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHEK2O96017 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHEK2O96017 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms