Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD3O95983 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD3O95983 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD3O95983 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD3O95983 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD3O95983 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD3O95983 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD3O95983 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MBD3O95983 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MBD3O95983 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MBD3O95983 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MBD3O95983 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MBD3O95983 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD3O95983 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD3O95983 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD3O95983 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD3O95983 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD3O95983 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD3O95983 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD3O95983 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD3O95983 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD3O95983 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD3O95983 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD3O95983 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD3O95983 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD3O95983 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD3O95983 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD3O95983 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD3O95983 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD3O95983 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD3O95983 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD3O95983 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD3O95983 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD3O95983 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD3O95983 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD3O95983 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD3O95983 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD3O95983 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD3O95983 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD3O95983 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD3O95983 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD3O95983 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD3O95983 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD3O95983 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD3O95983 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD3O95983 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD3O95983 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD3O95983 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD3O95983 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD3O95983 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD3O95983 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD3O95983 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MBD3O95983 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD3O95983 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD3O95983 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD3O95983 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD3O95983 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD3O95983 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD3O95983 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD3O95983 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD3O95983 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD3O95983 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD3O95983 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD3O95983 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD3O95983 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD3O95983 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MBD3O95983 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms