Protein–RNA interactions for Protein: O95907

SLC16A8, Monocarboxylate transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A8O95907 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A8O95907 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A8O95907 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A8O95907 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC16A8O95907 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC16A8O95907 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC16A8O95907 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A8O95907 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A8O95907 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms