Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STAMBPO95630 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms