Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNAPINO95295 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPINO95295 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms