Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATBO75879 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GATBO75879 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATBO75879 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATBO75879 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATBO75879 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATBO75879 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATBO75879 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATBO75879 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATBO75879 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATBO75879 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATBO75879 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATBO75879 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATBO75879 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATBO75879 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATBO75879 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATBO75879 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATBO75879 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATBO75879 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATBO75879 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATBO75879 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATBO75879 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATBO75879 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATBO75879 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GATBO75879 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATBO75879 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATBO75879 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATBO75879 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATBO75879 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GATBO75879 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATBO75879 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATBO75879 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATBO75879 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATBO75879 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATBO75879 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATBO75879 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATBO75879 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATBO75879 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATBO75879 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATBO75879 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATBO75879 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATBO75879 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATBO75879 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATBO75879 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATBO75879 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATBO75879 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATBO75879 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATBO75879 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATBO75879 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATBO75879 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATBO75879 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATBO75879 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATBO75879 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATBO75879 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATBO75879 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATBO75879 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATBO75879 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATBO75879 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATBO75879 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATBO75879 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATBO75879 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms