Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPSNAP2O75323 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NIPSNAP2O75323 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms