Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GADD45BO75293 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GADD45BO75293 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GADD45BO75293 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms