Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREM1O60565 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREM1O60565 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREM1O60565 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREM1O60565 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREM1O60565 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREM1O60565 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREM1O60565 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREM1O60565 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GREM1O60565 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GREM1O60565 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GREM1O60565 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GREM1O60565 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GREM1O60565 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GREM1O60565 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GREM1O60565 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GREM1O60565 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREM1O60565 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREM1O60565 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREM1O60565 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREM1O60565 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREM1O60565 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREM1O60565 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREM1O60565 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREM1O60565 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GREM1O60565 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GREM1O60565 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREM1O60565 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREM1O60565 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREM1O60565 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREM1O60565 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREM1O60565 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREM1O60565 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GREM1O60565 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREM1O60565 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREM1O60565 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GREM1O60565 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GREM1O60565 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GREM1O60565 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GREM1O60565 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GREM1O60565 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREM1O60565 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREM1O60565 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREM1O60565 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREM1O60565 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREM1O60565 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GREM1O60565 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREM1O60565 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREM1O60565 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREM1O60565 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREM1O60565 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREM1O60565 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREM1O60565 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GREM1O60565 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREM1O60565 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREM1O60565 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREM1O60565 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GREM1O60565 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREM1O60565 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREM1O60565 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREM1O60565 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREM1O60565 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GREM1O60565 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREM1O60565 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREM1O60565 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GREM1O60565 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREM1O60565 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREM1O60565 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREM1O60565 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GREM1O60565 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREM1O60565 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREM1O60565 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREM1O60565 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREM1O60565 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREM1O60565 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GREM1O60565 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREM1O60565 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREM1O60565 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREM1O60565 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREM1O60565 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GREM1O60565 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREM1O60565 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREM1O60565 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREM1O60565 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GREM1O60565 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREM1O60565 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREM1O60565 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREM1O60565 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREM1O60565 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GREM1O60565 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GREM1O60565 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GREM1O60565 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREM1O60565 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREM1O60565 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREM1O60565 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREM1O60565 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREM1O60565 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREM1O60565 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREM1O60565 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GREM1O60565 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms