Protein–RNA interactions for Protein: O43929

ORC4, Origin recognition complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC4O43929 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ORC4O43929 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ORC4O43929 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ORC4O43929 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ORC4O43929 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ORC4O43929 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ORC4O43929 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ORC4O43929 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ORC4O43929 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ORC4O43929 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ORC4O43929 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ORC4O43929 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ORC4O43929 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ORC4O43929 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ORC4O43929 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ORC4O43929 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ORC4O43929 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ORC4O43929 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ORC4O43929 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ORC4O43929 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ORC4O43929 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ORC4O43929 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ORC4O43929 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ORC4O43929 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ORC4O43929 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ORC4O43929 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ORC4O43929 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ORC4O43929 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ORC4O43929 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ORC4O43929 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ORC4O43929 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ORC4O43929 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ORC4O43929 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ORC4O43929 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ORC4O43929 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ORC4O43929 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ORC4O43929 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ORC4O43929 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ORC4O43929 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ORC4O43929 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ORC4O43929 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ORC4O43929 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ORC4O43929 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ORC4O43929 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ORC4O43929 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ORC4O43929 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ORC4O43929 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ORC4O43929 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ORC4O43929 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ORC4O43929 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ORC4O43929 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ORC4O43929 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ORC4O43929 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ORC4O43929 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ORC4O43929 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ORC4O43929 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ORC4O43929 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ORC4O43929 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ORC4O43929 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ORC4O43929 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ORC4O43929 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ORC4O43929 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ORC4O43929 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ORC4O43929 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ORC4O43929 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ORC4O43929 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ORC4O43929 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ORC4O43929 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ORC4O43929 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ORC4O43929 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ORC4O43929 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ORC4O43929 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ORC4O43929 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ORC4O43929 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ORC4O43929 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ORC4O43929 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ORC4O43929 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ORC4O43929 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ORC4O43929 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ORC4O43929 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ORC4O43929 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ORC4O43929 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ORC4O43929 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ORC4O43929 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ORC4O43929 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ORC4O43929 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ORC4O43929 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ORC4O43929 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ORC4O43929 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ORC4O43929 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ORC4O43929 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ORC4O43929 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ORC4O43929 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ORC4O43929 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ORC4O43929 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ORC4O43929 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ORC4O43929 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ORC4O43929 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ORC4O43929 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ORC4O43929 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms