Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP9BO43861 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP9BO43861 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms